Le développement embryonnaire précoce des plantes est assez bien connu pour les premiers stades. Pour mieux comprendre la morphogenèse et notamment la mise en place de la symétrie bilatérale chez A. thaliana, nous observons des embryons en microscopie de fluorescence à différents stades de développement. Nous présenterons ici les algorithmes que nous avons développés pour la reconstruction 3D de ces embryons et le lignage cellulaire. Nous présenterons aussi quelques résultats préliminaires relatifs à la modélisation mécanique de ces embryons.